Friday, July 16, 2010

Release

Hari ni rasa release sangat sebab file conversion berjaya disiapkan.
Adeh~ lama betul aku buat benda alah ni. Padahal file conversion je bukan develop system.
Itulah akibatnya bila skill programming dah lama tak asah. Karat! Nak fikir pun ala-ala rantai gerek bunyi lepas sapu minyak pelincir jenama Singer tu baru ok.

Ini nota yang Julie conteng kat buku nota aku. Dia dok ajar guna hash and keys dalam Perl. Entahlah otak aku ni lambat nak tangkap bab Perl. PHP cepat sikit. Tapi tak berapa sesuai PHP ni untuk large scale data. Jadi tak ada pilihan lain guna la Perl. Julie ajar aku faham. Sebelum ni dah pernah buat dengan Francis. Dia advance jadi cara ajar dia advance jugalah. Julie pun kata Francis memang minimize code bila buat programming. Lepas ni aku harap terror lah hash and keys untuk file conversion. Handle large scale data ni memang tak ada kerja lain melainkan data management and data conversion. Esok kena praktis lagi bagi mantap instead of inset data gff3 dalam database.

Yang ni Julie ajar guna Mosaik untuk data NGS. Next Generation Sequencing. Biasa kan orang align guna BLAST. Kat Malaysia mostly people guna BLAST. Tapi untuk NGS precisely guna MOSAIK untuk analysis result yang lebih mantap. Ada lagi satu tools yang boleh handle MSA untuk NGS. Ada tulis kat nota tu. AKu terbaca bagi ni satu poster pasal talk NGS. The problem in NGS is how to handle data for Bioinformatic analysis. Whoa! Kat sini aku dah belajar ilmu baru. Julie ajar step by step pasal Mosaik ni. All the contigs and the consensus how Mosaik can obtain these results.



Ini pula kelas dengan Gord. Segala random, fixed, model nak kena kenal pasti dan run model untuk dapatkan variance, estimation, standard error la. Adeh~ Jenuh dow. Aku tau generate results tapi nak interprate yilek.

Kelas Gord memang kena pasang telinga. Fokus. Kejap lagi 'Rabi, is that make sense?' 'Rabi, have u try bla bla'. Gord ni kalau nak kata..pangkat atok juga la dengan aku. Tapi so far memang kena struggle dalam kelas dia. Fikiran tak boleh melayang-layang. Dah la tak boleh bertentang mata. Katanya net conference je kan. Jadi dengar suara je la.

Letih..letih..dan letih...Tapi aku puas hati sebab programming part dah settle. Kalau tak jenuh dalam kepala fikir bila nak siap bila nak siap. Tak sempat nak sentuh sebab petang dah cuba latihan dari Gord. Asreml ni pula license. Kalau free boleh gak aku try kat rumah. Esok cuma insert dalam db, betulkan features kat Gbrowse. Whoa! Hari Jumaat yang indah. Harapnya.


p/s: quote hari ini:


"I see your face in my mind as I drive away
'Cause none of us thought it was gonna end that way
People are people and sometimes we change our minds
But it's killing me to see you go after all this time"


memang pun..itu yg aku fikir dalam kereta petang tadi


No comments:

Post a Comment